Біологи представили нове «древо життя»
Відео: Барбоскіни - 166 серія. дерево бажань
Оновлена версія філогенетичного древа більше схоже на кущ, в гілках якого домінують бактерії, включаючи велику групу, ще не отримала назву. Решті - в тому числі тваринам і рослинам, грибам і археям - тут відводиться досить скромне місце.
Стародавня метафора «древа життя» увійшла в науку з публікацією «Походження видів», в якій Дарвін вдається до неї для опису процесу еволюції. З тих пір біологи постійно вносять виправлення і уточнення в порядок, розміри і розташування «гілок». Сучасне розуміння механізмів і масштабів генетичного обміну багато в чому розмило уявлення про ізольованості цих гілок. Однак в цілому концепція «великого древа життя» залишається настільки зручною і наочною, що продовжує існувати і в наші дні.
Сьогоднішній вигляд еволюційного древа помітно відрізняється від дарвінського. У ньому з`явилися нові стовбури, нові гілки, незліченні гілочки і листя, а застосування методів порівняльного ДНК-аналізу дозволило точніше розташувати їх по відношенню один до одного. Перше дерево, побудоване з урахуванням цих нових даних, було представлено в 1990-х роках Карлом Воуз (Carl Woese) і його колегами, і у цього «древа життя» було три базових стовбура: еукаріоти (включаючи тварин, рослини, гриби і Найпростіші) , бактерії і археї - виділена лише в 1970-х роках група древніх і вкрай незвичайних мікробів, що відрізняються від бактерій куди сильніше, ніж ми від печериць.
Відео: 31. В. Железов Нове садівництво для шкільної біології Нової Росії. Навчальний фільм - 20
В останні дні технології вилучення та секвенування ДНК стали настільки доступними, що проводяться роботи з масового вивчення геномів усіх трьох стовбурів «древа життя». Таку копітку роботу виконали недавно Джиліан Бенфілд (Jillian Banfield) і її колеги з Каліфорнійського університету в Берклі. Вчені отримали дані ДНК 2072 відомих і 1011 нових видів архей, зовсім недавно виявлених в найбільш екстремальних і складних для проживання екологічних нішах, де ці організми почуваються куди краще і еукаріот, і бактерій.
До цих даних вони додали відомі ДНК-послідовності більш ніж 30 тис. Інших організмів і за допомогою суперкомп`ютера провели їх порівняння. Вийшло в результаті «древо життя» - то, яким воно виглядає з точки зору сучасної біології, - Дарвіна б вельми здивувало. Вчені підтвердили колишні погляди на спорідненість архей і еукаріот, які тепер об`єднані в єдиний стовбур. Для нас особливо вражаючим виглядає велике розмаїття бактерій, які тут явно домінують.
Відео: 23. В. Железов. Нове садівництво для шкільної біології Нової Росії. Навчальний фільм - 12
На дереві розташовані 92 групи бактерій і 26 груп архей, для деяких вказані характерні, добре вивчені підгрупи. Представлено всі п`ять груп еукаріот: заднежгутіковие (куди входять гриби і тварини), архепластіди (рослини і водорості), а також Найпростіші - хромальвеоляти, екскавато і амебозоі. / © Laura A. Hug et al., 2016
На ньому вперше можна бачити величезну - більше, ніж весь «ствол» архей і еукаріот, - і, мабуть, надзвичайно давню групу бактерій, позначену як Сandidate Phyla Radiation. Ця велика група гілок, як видно з назви, поки не отримала гідного опису і підтвердження, проте включає чи не половину відомих видів прокаріот, в основному мешканців ґрунтових биомов. «Це переломний відкриття, - прокоментував роботу відомий біоінформатики Євген Кунин для New York Times, - цілий континент нових живих форм».
